單體藥店因?yàn)榻?jīng)營(yíng)者的自主意識(shí)占據(jù)主體，所以與連鎖藥店相比有一定的優(yōu)勢(shì)，比如：自主操控性強(qiáng)、實(shí)施新方案進(jìn)度快等。但是單體藥店也有它自身的劣勢(shì)，這些劣勢(shì)到底有哪些呢？
1、國(guó)家政策不利單體藥店
（1）、藥品零售的分類管理，處方藥受限，"處方藥須憑處方購(gòu)買"、"精神類藥品不可經(jīng)營(yíng)"等政策。使得很多藥店的生意額下降最多達(dá)到1/3；
（2）、由于國(guó)家政策的導(dǎo)向，2006年以來(lái)，社區(qū)衛(wèi)生服務(wù)機(jī)構(gòu)不斷擴(kuò)大市場(chǎng)份額，連鎖藥店和單體藥店均面臨客戶流失，尤其是醫(yī)保類客戶流失的難題；
（3）、國(guó)家醫(yī)藥行業(yè)十一五規(guī)劃中又明確鼓勵(lì)發(fā)展連鎖，全國(guó)藥店連鎖化程度也在大幅度提高。
2、競(jìng)爭(zhēng)因素不利于單體藥店：
發(fā)展迅速的連鎖藥店正越來(lái)越像醫(yī)藥市場(chǎng)的"主力軍"，嚴(yán)重沖擊單體藥店，連鎖藥店都是一條龍、一次性的向廠家訂貨，一次性把藥放在自己連鎖中銷售，還有自己的貼牌產(chǎn)品，他們有了高利潤(rùn)，控制市場(chǎng)以大吃小，回過(guò)頭來(lái)做服務(wù)，拿品牌藥來(lái)開刀降價(jià)，大打價(jià)格戰(zhàn)，宣傳他們是零利潤(rùn)，使原來(lái)單體零售藥店的大部分消費(fèi)者紛紛轉(zhuǎn)移購(gòu)買地點(diǎn)。與此相比，單體藥店無(wú)論是銷售規(guī)模還是企業(yè)實(shí)力都與這些"主力軍"相去甚遠(yuǎn)，只能在夾縫中生存。
另外，連鎖藥店有采購(gòu)成本優(yōu)勢(shì)，可以總代理、可以要求廠家直供連鎖，可以占?jí)汗?yīng)商資金，可以要求廠家提高力度協(xié)助其促銷。另外連鎖藥店還具有管理優(yōu)勢(shì)，他們有定期培訓(xùn)機(jī)制，廠家也愿意協(xié)助其培訓(xùn)，這些都是社會(huì)單體藥店不具備的。
3、單體藥店自身的不足因素
①、是進(jìn)貨渠道單一。單體藥店由于資金運(yùn)轉(zhuǎn)周期長(zhǎng)、進(jìn)貨量少，不能吸引批發(fā)企業(yè)在銷售策略方面給予傾斜，因而限制了貨源的范圍，購(gòu)進(jìn)質(zhì)優(yōu)價(jià)廉產(chǎn)品的余地不大。
②、是藥價(jià)相對(duì)高。單體藥店自主購(gòu)進(jìn)藥品，因進(jìn)貨價(jià)格相對(duì)較高，加之實(shí)行獨(dú)立的成本核算，經(jīng)營(yíng)成本相對(duì)高于連鎖企業(yè)門店，使得藥品零售價(jià)格偏高。
③、是市場(chǎng)信息欠靈通。單體藥店通常是"單打獨(dú)斗"，相互之間缺乏溝通，時(shí)常不能及時(shí)地獲得市場(chǎng)信息，以致影響經(jīng)營(yíng)措施的及時(shí)有效調(diào)整。
④、是業(yè)務(wù)知識(shí)更新慢。單體藥店人員少，且不能正常流動(dòng)，接受的正規(guī)培訓(xùn)少。
⑤、是抵御風(fēng)險(xiǎn)能力差。單體藥店是醫(yī)藥商海中名副其實(shí)的"獨(dú)木舟"，獨(dú)自承受來(lái)自各方面的壓力，他們深感勢(shì)單力薄、舉步維艱，在與連鎖企業(yè)和醫(yī)療機(jī)構(gòu)的競(jìng)爭(zhēng)中往往處于劣勢(shì)，有的慘淡經(jīng)營(yíng)，有的被迫下馬。
4、藥品生產(chǎn)企業(yè)的冷眼相待。
因?yàn)橘Y金實(shí)力小，銷量小，經(jīng)營(yíng)場(chǎng)地小，大品牌的醫(yī)藥企業(yè)往往不愿意將單體藥店作為主要終端，認(rèn)為投入產(chǎn)出比不合理，既無(wú)人員支持，也無(wú)促銷支持。這進(jìn)一步將單體藥店推向了尷尬的境地。
